Фамилия Федунцов — редкий пример того, как в русской ономастике сталкиваются две разные традиции: каноническое имя и народная уменьшительная форма. В основе фамилии лежит имя Федун, которое является производной формой от крестильного имени Феодор (в просторечии Фёдор). Цепочка проста: Феодор → Федул (через народное переосмысление) → Федун (ласкательный суффикс -ун). Таким образом, Федунцов буквально означает «потомок Федуна».

Главная особенность этой фамилии — суффикс -ц- в середине (Федун-ц-ов), который встречается нечасто. Обычно от имён на -ун образуются фамилии с суффиксом -ов напрямую: Федунов. Вариант Федунцов говорит о том, что в основе лежала не просто фамилия, а прозвище или патроним с дополнительным суффиксом -ец (Федунец — «маленький Федун»). Позже, при оформлении фамилии, к этой основе добавили стандартный русский суффикс -ов. Иными словами, предка могли звать не Федун, а Федунец — и эта форма закрепилась в документах.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским говорам, где суффикс -ец в прозвищах был особенно активен. Встречается она в основном в Курской, Белгородской, Ростовской областях и на Кубани. Социальный состав носителей — преимущественно крестьянство и казачество; фамилия не дворянская и не купеческая, что подтверждается её простой словообразовательной моделью.

В написании фамилии возможна путаница с более распространённой Федунцов (через «о» после «ц») — но вариант через «е» (Федунцов) встречается реже и может указывать на местное произношение с «еканьем». Если ваш предок носил фамилию Федунцов, с высокой вероятностью он происходил из среды однодворцев или казаков Черноземья, а родоначальником был человек по прозвищу Федунец.