Фамилия Федунова восходит к старинному русскому имени Федун — так в народе называли человека, носившего церковное имя Феодул или Феодор. Разбор показывает, что перед нами классическая «патронимическая» модель: суффикс -ов присоединялся к основе и означал «сын такого-то» или «из семьи такого-то». То есть Федунова — это буквально «дочь или жена Федуна», а изначально фамилия закрепилась за потомками человека с этим именем.

Имя Феодул пришло из древнегреческого языка и переводится как «раб богов». Второй возможный источник — Феодор, что означает «подаренный богом». В XVI–XVII веках имя Феодор в просторечной форме Фёдор было одним из самых употребительных русских имён и уступало по частоте лишь Ивану и Василию. Именно из этой простонародной среды и вышла уменьшительная форма Федун: такие сокращения, как Федун, Федул, Федя, были естественным способом называть человека в быту, вдали от официальных церковных сводов.

Скорее всего, основатель рода Федуновых принадлежал к простому сословию — крестьянам или посадским людям. Фамилии с суффиксом -ов в ту пору массово закреплялись за крестьянскими семьями после отмены местничества и в ходе переписей. Знатного происхождения у этой фамилии не прослеживается, и это типичная история: имя, популярное среди народа, дало начало целому гнезду однокоренных фамилий — Федулов, Федюнин, Федин, Федькин.

Интересная деталь: форма Федун, а не Федул, встречается реже и отражает живую народную перестройку имени. В говорах конечный [л] перед гласным иногда выпадал или заменялся, поэтому Федул превращался в Федуна. Такая особенность указывает на региональный оттенок — подобные стяжения чаще встречались в северных и центральных русских говорах.

В итоге фамилия Федунова — это не прозвище по занятию или черте характера, а именно память о личном имени предка. Она рассказывает о человеке, которого в его деревне знали как Федуна, и о том, что его потомки, вероятно, были людьми трудовыми, незнатными, но с устойчивым родовым именем, которое пережило века.