Фамилия Федунин — это классический пример русской «полуотчественной» фамилии, которая закрепилась за потомками человека по имени Федуня. Вопреки распространённому мнению, в основе лежит не самостоятельное имя, а производная, уменьшительно-ласкательная форма канонического церковного имени Феодор. Само имя Феодор пришло на Русь вместе с христианством из Византии, а в древнегреческом языке (theodoros) оно означало «божий дар», то есть буквально «данный Богом».

Словообразовательная модель здесь прозрачна и типична для XVI–XVII веков, когда фамилии активно формировались у крестьян и посадских людей. К основе Федун- добавили суффикс -ин, который указывал на принадлежность: Федунин означало «чей-то сын», «ребёнок Федуни». Такой способ был настолько распространён, что фамилии на -ин в центральной и северной России встречаются ничуть не реже, чем фамилии на -ов/-ев. Интересно, что форма Федуня — не единственный «след» имени Феодор в русских фамилиях: от него же произошли Федин, Федюнин, Федорин и даже Федорей. Но именно вариант с суффиксом -ун- придаёт фамилии особый оттенок: в древнерусском языке такие формы (Борзун, Говорун, Федун) часто несли экспрессивный, порой ироничный оттенок, выделяя человека по какой-то яркой черте.

О точном месте и времени возникновения фамилии Федунин говорить сложно: процесс формирования фамилий шёл неравномерно, и в разных регионах он растянулся на несколько столетий. Однако можно предположить, что фамилия закрепилась в среде, где было сильно влияние церковных имён, но при этом в быту люди предпочитали сокращённые, «домашние» варианты. Показательно, что носители фамилии Федунины встречаются и в центральных областях России, и в Поволжье, что указывает на широкое бытование имени Федуня в разговорной речи.

Сегодня фамилия Федунин воспринимается как исконно русская, хотя её корни уходят в византийскую традицию. Она остаётся своеобразным памятником славянской письменности и культуры: в ней, как в капле воды, отразился долгий путь от церковного календаря до повседневного прозвища и, наконец, до родового имени, которое мы носим спустя столетия.