Фамилия Фефилин — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, минуя крестильное имя. В основе лежит не Феофил (греческое «боголюбивый»), а диалектное слово «фефила» — так в некоторых русских говорах называли неряху, неопрятного человека. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Фефилин буквально значит «сын (или потомок) Фефилы», то есть человека с таким прозвищем.

Версия о происхождении от канонического имени Феофил менее убедительна. От Феофила образовались бы фамилии Феофилов, Феофильев или Фефилов (с усечением), но форма Фефилин с суффиксом -ин обычно закрепляется за прозвищами, а не за полными крестильными именами. К тому же в ономастических работах В. Никонова и С. Веселовского зафиксированы именно прозвищные модели на -ила (Фефила, Неумывака, Замарай), которые становились основой для фамилий.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России — Вологодской, Костромской, Кировской областям, где говоры сохранили слово «фефила» в значении «растрёпа». Встречается она нечасто: по данным современных баз, Фефилиных насчитывается около двух-трёх тысяч человек, в основном в России.

Интересно, что у фамилии есть вариант Фефелин — с тем же корнем, но с другим суффиксальным оформлением. Это либо результат диалектного чередования (и/е в безударной позиции), либо параллельное образование от той же основы. Оба варианта указывают на одно и то же прозвище, но письменная фиксация разошлась.

Так что предок носителя фамилии Фефилин — вовсе не обязательно боголюбивый Феофил. Скорее всего, это был человек, за которым в деревне закрепилось прозвище за неопрятный вид, а потомки уже получили фамилию по этому прозвищу. Простая и живая история, без церковного налёта.