Фамилия Филаткова отвечает на вопрос «чей?» и образована от мужского имени Филаток — так на Руси в быту, по-соседски, называли человека с крестильным именем Феофилакт. Это имя греческого происхождения, и переводится оно как «богохранимый»: theos — «Бог» и phylasso — «охраняю, стерегу». В церковном календаре имя соотносится с Блаженным Феофилактом Болгарским, архиепископом, жившим на рубеже XI–XII веков (в народной памяти его иногда ошибочно относят к XVI столетию). Он прославился не суровой аскезой, а духом терпимости и знаменитыми толкованиями Нового Завета — эти комментарии веками использовались как учебное чтение.

Сам разбор фамилии показывает, что перед нами типичная «патронимическая» модель: суффикс -ов/-а присоединялся к основе, чтобы указать на принадлежность. Филаткова буквально значит «дочь (или жена) Филатка». Производная форма Филаток возникла из-за того, что длинное имя Феофилакт в живой речи сокращали, отбрасывая начало: так из Феофилакта получался Филат, а ласкательный вариант Филаток закрепился в документах как основа фамилии.

Скорее всего, основатель рода Филатковых был выходцем из простого сословия. В среде крестьян и посадских людей полное церковное имя звучало слишком торжественно, поэтому в быту использовали краткие варианты, которые потом и становились фамилиями. Дворянские же роды чаще фиксировали полную форму — отсюда редкая фамилия Феофилактов, в то время как Филатковы и Филатовы распространены гораздо шире.

Интересно, что фамилия Филаткова встречается в разных регионах России без явной привязки к одной местности — это говорит о том, что имя Филат было общенародным, а не локальным. По той же модели образованы однокоренные Филатов, Филатьев, Филаткин; все они восходят к одному источнику, но различаются тем, какой именно уменьшительной формой имени пользовались предки. Таким образом, потомок человека по имени Филаток со временем получил фамилию Филаткова, и в ней сохранилась память о том, как звучало имя предка в повседневной речи.