Основой фамилии Фильев послужило церковное имя Филий. Крестильное мужское имя Филий в переводе с греческого на русский язык означает «дружелюбный». Скорее всего, основатель рода Фильевых был представителем привилегированного сословия. Покровителем имени является священномученик Филий Епископ. Его именины приходятся на 28 (15) сентября. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Филий, со временем получил фамилию Фильев.