Фамилия Филонов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Филонов послужило церковное имя Филон. Фамилия Филонов восходит к крестильному мужскому имени Филон, которое в переводе с греческого означает «любящий». Однако не исключено, что Филон представляет собой стяженную форму имени Филимон, тоже связанным с понятием «любить». Не исключено, но менее вероятно, что фамилия Филонов образована от нарицательного «филон», т.е. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Филон, со временем получил фамилию Филонов. О точном месте и времени возникновения фамилии Филонов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Филонов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.