Фамилия Фленко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в украинской ономастике, изначально означал «сын» или «потомок». Таким образом, Фленко — это «сын Фли» или «потомок человека по прозвищу Фля». Основа фамилии — сокращённая, производная форма, что типично для прозвищного словообразования.

Корень «Фл-» не имеет очевидной славянской этимологии, что указывает на заимствованное происхождение прозвища. Наиболее вероятная версия связывает его с греческим именем Филипп (в переводе — «любящий коней»). В народной речи имя Филипп давало множество сокращений: Филя, Филипка, а также Фленя (с характерным для украинского языка переходом «и» в «е» под ударением). От Флени и возникло прозвище Фля, которое и легло в основу фамилии. По другой, менее распространённой версии, прозвище Фля могло относиться к человеку, который носил флягу или торговал флягами, но это объяснение менее убедительно, так как слово «фляга» в украинском языке звучит как «фляшка», а корень «фл-» в прозвищах чаще всего восходит к личным именам.

География фамилии подтверждает её украинское происхождение. Фленко встречается преимущественно на востоке Украины и в южных областях России, куда шли переселенческие потоки. В XIX веке носители фамилии были в основном крестьянами и казаками, что типично для фамилий на -енко в Малороссии. Сословная принадлежность была однородной: никаких дворянских родов Фленко не зафиксировано — это фамилия простых людей.

Интересная деталь: в русском языке фамилия часто подвергалась искажению — её могли записывать как Флинко, под влиянием привычного суффикса -ин. Но исходная форма Фленко сохранилась лучше, поскольку в украинской традиции ударение падает на второй слог: Фле́нко, а не Фленко́. Эта особенность произношения — ещё один ключ к тому, что перед нами не случайная адаптация, а устойчивая фамильная модель, образованная от имени-прозвища.