Фамилия Флорю — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели на -ов, -ин или -ский, а её окончание -ю сразу выдаёт нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, пришедшая из молдавской или румынской языковой среды, где суффикс -ю (-iu) образует фамилии от личных имён или прозвищ. В таком случае основа Флор- восходит к румынскому имени Flor, которое, в свою очередь, является сокращением от Florea или Florin — аналогов русского имени Флор (от латинского flos, floris — «цветок»). Таким образом, фамилия Флорю могла означать «потомок Флора» или просто «цветочный», «цветущий».

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — украинское происхождение. В украинской антропонимии встречаются фамилии с окончанием -ю, например, Гнатю, Костю. Если допустить украинский след, то Флорю могло образоваться от уменьшительной формы имени Флор — Флорь, с последующим добавлением патронимического окончания -ю (как у фамилий на -енко, но в западных говорах). Однако такое окончание для украинских фамилий скорее исключение, чем правило, и чаще встречается в западных регионах, граничащих с Румынией.

Географически фамилия Флорю сегодня практически не встречается в России. Основной ареал — Молдова и прилегающие области Украины (особенно Черновицкая и Одесская). В дореволюционных метрических книгах Бессарабской губернии можно найти носителей этой фамилии среди крестьян и мещан, что указывает на её давнюю укоренённость в регионе.

С точки зрения словообразования, фамилия Флорю стоит особняком: она не содержит русского суффикса принадлежности, а значит, её носители — потомки выходцев из румыноязычной среды, которые сохранили исходную форму родового прозвища без русификации. Это редкий пример, когда фамилия не адаптировалась под стандартные русские модели, а осталась маркером этнического происхождения.