Фамилия Фондякова (и её мужская форма Фондяков) хранит в себе историю прозвища, которое старше самой фамилии. В основе лежит слово «фонд» — в старом значении «основной источник», «капиталы», «финансы». От него образовали прозвище Фондяк, которое, скорее всего, носило профессиональный характер. Так могли называть казначея — человека, который ведал деньгами, распоряжался общими средствами. Прозвище могло указывать и на социальное положение: Фондяком могли прозвать зажиточного, состоятельного человека, у которого, что называется, «был фонд».

Прозвище Фондяк закрепилось за человеком как обиходное именование, а затем, по распространённой модели, легло в основу фамилии: Фондяков — то есть сын, потомок Фондяка. Со временем форма Фондякова закрепилась за женщинами, а мужская ветвь сохранила окончание -ов. Суффикс -як в прозвище придавал слову разговорный, бытовой оттенок, что типично для имён, возникших в крестьянской или посадской среде.

Сам корень «фонд» в русский язык пришёл из латыни через западноевропейские языки, но в народной речи он прижился именно в значении «запас», «основа», «денежные средства». Поэтому версия о связи прозвища с финансами выглядит правдоподобнее, чем попытки искать в нём иноязычные корни. Фамилия редкая, встречается точечно, что говорит о её локальном происхождении — вероятно, в одном регионе или даже в одном селе, где жил человек, получивший прозвище Фондяк.

Так фамилия Фондякова, передаваясь из поколения в поколение, сохранила память о предке, который, возможно, вёл денежные дела или просто слыл человеком достаточным. Сегодня она остаётся ценным источником семейной истории: по ней можно восстановить, чем занимался и как жил её первый носитель.