Фамилия Габакук — редкий случай, когда за основу взято не каноническое церковное имя, а его народная, упрощённая форма. В основе лежит библейское имя Аввакум (в русской традиции через «а» — Абакум), которое носил один из малых пророков Ветхого Завета. Начальное «Г» в фамилии — результат диалектного или бытового приставного звука, который в русских говорах часто появлялся перед гласной: вместо «Абакум» говорили «Габакум». Такое же явление мы видим в фамилиях Габасов (от Абас), Гавдей (от Авдей) или Гапон (от Агафон). Фамилия образована по простой модели: имя Габаку(м) + суффикс принадлежности -ов/-ев. Суффикс указывает на то, что предка звали Габакуком, и его потомки получили прозвание по отцу.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду таких же «приставных» вариантов, как Габалин (от Обалдуй, хотя и с другим значением) или Габашов. Интересно, что исходное имя Аввакум в древнерусском языке часто переосмысливалось: его сближали с глаголом «бакулить» — говорить, болтать, а также с корнем «бакул» (говорун, краснобай). Поэтому Габакук могло быть не только производным от имени, но и прозвищем для словоохотливого человека, хотя это вторичное значение.

География фамилии очень узкая. Габакук — типично южнорусская или украинская фамилия, встречающаяся в основном в бывших Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниях. В центральных и северных областях России она практически не фиксируется. Носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской или казачьей среды, где имена в обиходе сильно искажались. В документах XVII–XVIII веков встречаются написания «Габакум» и «Габакумов», но форма без конечного «м» (Габакук) — более редкая, она могла возникнуть из-за того, что в украинском произношении конечный согласный оглушался: Габакум произносилось как Габаку[м], а на письме закрепилось как Габакук.

В отличие от фамилии Абакумов, которая распространена повсеместно, Габакук — её региональный, «оглушённый» вариант, сохранивший живую народную фонетику. Если вы носите эту фамилию, ваши предки, вероятно, жили на юго-западе России или на Слобожанщине и в быту пользовались не полным церковным именем, а его местным, «срезанным» вариантом.