Фамилия Габижова интересна прежде всего своей моделью образования и географической привязкой. Она явно несёт на себе отпечаток ареала, где фамилии на -ов/-ев, -ин и -ский соседствуют с более редкими суффиксами, характерными для северных и северо-западных регионов России.

В основе фамилии лежит суффикс -ов-, который присоединяется к основе Габиж. Этот суффикс — самый распространённый в русской фамильной системе, он указывает на принадлежность («чей?» — сын Габижа). Однако корень Габиж — нетипичный для великорусских говоров. Скорее всего, он восходит к прозвищному или календарному имени, которое попало в русскую среду через финно-угорское или тюркское посредничество.

Наиболее правдоподобная версия связывает фамилию с диалектным словом или прозвищем «габижа», которое могло бытовать в коми-пермяцких или удмуртских говорах. В этих языках основа «габ» или «габи» нередко встречается в личных именах и прозвищах, обозначая либо «горбатого», либо «увальня», «неповоротливого человека». Суффикс -ж- в таком случае мог служить словообразовательным элементом, типичным для местных прозвищ. Таким образом, Габиж — это прозвище, данное по внешности или характеру.

Менее вероятна, но возможна связь с искажённой формой крестильного имени Гавриил (в народной форме Габриэль). В этом случае Габиж могло быть бытовым вариантом имени, а Габижов — «сын Габижа». Однако для полного имени такое сильное фонетическое упрощение маловероятно, поэтому версия с прозвищем выглядит убедительнее.

Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, происходят из зоны контакта русского и финно-угорского населения — из Пермского края, Кировской области или Республики Коми. В этих местах фамилии с нестандартными для центральной России корнями — обычное дело, они фиксируют древние прозвища, которые так и не переросли в более привычные формы.