Фамилия Галимотья — редкая и необычная даже на фоне других русских фамилий. Её основа, скорее всего, не связана с географическими названиями или церковными именами, а происходит от прозвища. Если отбросить окончание -я, типичное для фамилий украинского или южнорусского происхождения (ср. Паливода, Непийвода), в центре оказывается корень «галим-», который напрямую отсылает к слову «галимотья».

В русских говорах, особенно южных и западных, «галимотья» (или «галиматья») означало бессмыслицу, чепуху, вздор. Это слово известно по крайней мере с XVIII века и активно использовалось в бытовой речи. Прозвище Галимотья могли дать человеку, который говорил сбивчиво, путано, нес околесицу, или же тому, кто постоянно попадал в нелепые, несуразные ситуации. Вторая возможная, но менее вероятная версия — связь с диалектным «галить» (насмехаться, дразнить). В этом случае прозвище мог получить балагур или шутник.

Суффиксальная модель здесь простая: фамилия образована бессуфиксным способом — прозвище перешло в фамилию без изменений, что характерно для фамилий украинского и белорусского происхождения (типа «Голота» или «Мазница»). В русской традиции такие фамилии чаще оформлялись суффиксами -ов/-ев, поэтому «Галимотья» указывает на возможные корни носителя в западнорусских или малороссийских землях. Встречается фамилия преимущественно в южных областях России и на востоке Украины, но везде крайне редко.

Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казачьей: прозвища такого типа давали в среде, где ценилась прямота и острота языка, а не в дворянских кругах. Никаких известных исторических деятелей с этой фамилией не зафиксировано — она осталась в тени, что делает её особенно ценной для семейной истории: каждый носитель фамилии Галимотья может считать, что его предок был человеком с характером, не боявшимся говорить правду или шутить даже в ущерб собственному прозвищу.