Фамилия Гандаков — редкий случай, когда тюркская основа, скорее всего, не связана с прозвищем, а напрямую происходит от личного имени. В основе лежит мужское имя Гандак (или Гандак-бай). Это имя фиксируется у татар, башкир и других тюркских народов, и его значение прозрачно: «ганд» — бобёр, «ак» — белый. То есть Гандак — «белый бобёр». В тюркской антропонимии названия животных часто становились именами-оберегами, символизирующими силу, ловкость или богатство (бобровый мех ценился высоко).

Русский суффикс -ов присоединился к основе, когда имя Гандак вошло в русскую среду, скорее всего, через межэтнические браки или при записи служилых татар в казачество. Фамилия образована по стандартной модели «имя отца + -ов», то есть Гандаков — «сын Гандака». Такой тип фамилий — один из самых массовых в России, но редкая основа делает Гандаковых носителями уникальной ономастической единицы.

В отличие от многих фамилий на -ов, где корень — явное прозвище (Кузнецов, Попов), здесь мы видим прямой перенос личного имени, что указывает на относительно позднюю фиксацию фамилии в среде, где тюркские имена ещё не успели полностью вытесниться русскими. Географически Гандаковы встречаются в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — в зоне активного контакта русского и тюркского населения.

Стоит отметить, что фамилия не имеет отношения к слову «гандак» в значении «канава» или «ров» (из персидского через тюркские языки), хотя такое созвучие есть. Версия с «канавой» — народная этимология, не выдерживающая критики: прозвище «Канава» могло бы дать фамилию Канавкин или Канавов, но не Гандаков. Ударение в фамилии, по правилам русской орфоэпии, падает на последний слог — Гандако́в, хотя в устной речи отдельных семей может смещаться на второй слог под влиянием исходного имени.

Таким образом, Гандаков — это не «сын того, кто копал канавы», а потомок человека, которого в XVI–XVII веках назвали в честь белого бобра. Фамилия сохранила память о древнем тюркском обычае давать детям «звериные» имена-талисманы, и в этом её главная историческая ценность.