Фамилия Гандаров — один из тех случаев, когда внутренняя форма слова затемнена, и без диалектной лексики не обойтись. На первый взгляд, в основе лежит что-то нерусское: окончание -ов вполне славянское, а вот корень «гандр» на слух кажется заимствованным. Так и есть, но заимствование это древнее и хорошо освоенное русскими говорами.

Вероятнее всего, фамилия образована от прозвища Гандар. В южнорусских и украинских говорах «гандар» — это кастрированный баран, валух. Прозвище могли дать либо пастуху, который занимался холощением скота, либо человеку с тихим, безобидным нравом — в переносном смысле. Модель образования простейшая: прозвище на согласный + типичный фамильный суффикс -ов, указывающий на принадлежность («сын Гандара»).

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с тюркским «гандар» (кровь, кровавый), но в русской антропонимии такие прозвища редки и обычно несли негативный оттенок. Поскольку фамилия не выглядит как искусственная семинарская или дворянская, бытовая версия с животноводческим корнем предпочтительнее.

Географически фамилия тяготеет к зоне распространения южнорусского диалекта — Воронежская, Ростовская области, Краснодарский край, а также к украинским землям, где слово «гандар» было в ходу. Встречается и у донских казаков, что логично: скотоводство — основа их хозяйства.

В написании фамилии возможна путаница с однокоренной Гандаров, но ударение, по правилам русской фамильной акцентологии, скорее всего падает на последний слог — Гандаро́в. Встречается и вариант Гондаров (через «о»), что отражает акающее произношение юга.