Имя Ганька является просторечной формой крестильного мужского имени Гавриил, которое в переводе с древнееврейского означает «божественный воин» или «моя сила - Бог». Скорее всего, основатель рода Ганькиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ганька, со временем получил фамилию Ганькина.