Фамилия Ганькины, как и многие русские фамилии, произошла от имени собственного. В её основе лежит просторечная форма канонического имени Гавриил — Ганька. Имя Гавриил имеет древнееврейские корни и означает «божественный воин» или «моя сила — Бог». На Руси оно было популярно, и его многочисленные уменьшительные формы (Ганя, Ганька, Ганюшка) дали начало целому ряду фамилий — Ганькины, Ганины, Ганюшкины.

Фамилия Ганькины образована по стандартной русской модели: к основе на -а (Ганьк-) добавлялся притяжательный суффикс -ин, который указывал на принадлежность: «чей?» — «Ганькин сын», то есть потомок Ганьки. Со временем форма родительного падежа закрепилась как наследственное родовое имя, и в окончании множественного числа (-ы) мы видим указание на целый род или семейство Ганькиных.

Точное место и время возникновения этой фамилии сейчас определить сложно: фамилии у крестьян и мещан центральной России закреплялись вплоть до конца XIX века. Однако, судя по форме на -ин, это типичная «вотчинная» фамилия, характерная для северных и центральных областей России, где суффикс -ин был распространён шире, чем на юге.

Интересно, что Ганька — не единственная производная форма от Гавриила. В разных говорах бытовали варианты Гаврик, Гарик, Гаша, Гавша. Если бы в основе лежал, к примеру, вариант Гарик, фамилия звучала бы как Гариковы. Таким образом, фамилия Ганькины — это не просто родовое прозвище, а своеобразный лингвистический след, сохранивший для нас живую, разговорную форму имени, которая почти исчезла из повседневного обихода.