Фамилия Ганьковский происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Ганьковский ведет свое начало от топонима Ганьково - в России существует несколько деревень и сел с таким названием (например, в Ленинградской области). Скорее всего, предок обладателя фамилии Ганьковский был уроженцем одного из этих селений. Само название Ганьково происходит от имени Ганька, которое является просторечной формой крестильного мужского имени Гавриил. В переводе с древнееврейского оно означает «божественный воин» или «моя сила - Бог». В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Ганьковский, со временем получил фамилию Ганьковский. О точном месте и времени возникновения фамилии Ганьковский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ганьковский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.