Фамилия Ганза — редкий случай, когда у слова-основы есть сразу несколько совершенно разных значений, и какое из них легло в фамилию, зависит от того, где жили предки. Самая конкретная версия отсылает в Сибирь: там «ганзой» называли монгольскую или китайскую курительную трубочку. Прозвище могли дать либо купцу, торговавшему с Востоком, либо заядлому курильщику такой трубки.

Вторая линия ведёт на Украину. Ганза — это фонетический вариант фамилий Ганжа и Ганджа. А «ганджа» в украинских говорах — не только фамилия, но и название сосуда. В таком случае прозвище мог получить мастер-стеклодув или гончар. Но у того же слова было и другое значение — «древесный спирт», поэтому предок мог заниматься изготовлением хмельных напитков.

Третья версия — географическая. Фамилия могла возникнуть у выходца из города Гянджа (в старых русских записях — Ганжа). Это второй по величине город Азербайджана, основанный ещё в VIII веке до н. э. и в разное время входивший в состав Персии, Грузии и Российской империи. Если предок был родом оттуда или долго жил на территории бывшего Закавказского ханства, фамилия могла закрепиться по месту происхождения.

Известен реальный носитель фамилии — украинец Ганза Макар Гаврилович, родившийся в 1894 году в Екатеринославской губернии (село Ново-Васильевка Бахмутского района). Эти сведения сохранились в архивах Комитета национальной безопасности по Восточно-Казахстанской области. Украинское происхождение Макара Гавриловича поддерживает версию о связи фамилии с украинскими Ганжой и Ганджой, а не с сибирской курительной трубкой.