Фамилия Гербековы — редкий пример, где за привычным русским суффиксом -ов скрывается нерусская основа. Вопреки возможной догадке, она не связана с немецким словом «герб» (Wappen) или фамильным гербом. Корень здесь тюркский, и географически фамилия тяготеет к Северному Кавказу, в первую очередь к адыгским (черкесским) народам.

Словообразовательная модель проста: к основе Гербек (имя или прозвище) добавили русский патронимический суффикс -ов, что типично для многих фамилий народов Кавказа, вошедших в состав Российской империи. Суффикс указывает на принадлежность: «Гербеков» — потомок или сын Гербека.

Само имя Гербек (Гърбек) имеет две основные версии происхождения. Первая и наиболее вероятная — от адыгского (черкесского) «гъэр бэгъ» — «сильная рука» или «рука, полная силы». В таком случае прозвище мог получить сильный, работящий или умелый в бою человек. Вторая версия возводит имя к арабскому компоненту «Гарбек» (редкая форма, связанная с «гарб» — запад), но она менее убедительна для кавказского контекста.

Сословная принадлежность Гербековых, скорее всего, не была единой. Среди адыгских фамилий на -ов встречались и княжеские (пщы), и дворянские (уорки), и свободные общинники (тфокотли). Без генеалогического исследования конкретной ветви определить статус предков невозможно: Гербеков мог быть и узденем (дворянином), и крестьянином. Фамилия не даёт подсказок о ремесле — она образована от личного имени, а не от профессии.

В написании фамилия устойчива, вариантов вроде «Гербек» (без суффикса) встречаются редко и обычно фиксируются как отдельные фамилии у других тюркских народов. В русском языке фамилия склоняется по стандартному образцу: Гербеков, Гербекова, Гербекову и так далее. Ударение, судя по адыгской фонетике, падает на последний слог основы — Гербекóв, хотя в бытовой речи возможны колебания.