Фамилия Гердун — редкий случай, когда в основе лежит не славянское прозвище, а личное имя, пришедшее в немецкий язык вместе с христианством. Во второй половине VIII века в обиход германских народов начинают входить библейские и греко-латинские имена: Адам («первородный»), Андреас («храбрый»), Виктор («победитель») и другие. К этому же потоку относится и имя Герд.

Само имя Герд — это краткая форма от Герхард (древнегерманское ger — «копье» и hart — «твердый, сильный»). Получается, что Герд означает «сильный копьем» или «твердый как копье». Такие имена в средневековой Европе были популярны у воинов и знати, но со временем распространились и среди простых людей. Фамилия Гердун образована от этой основы с помощью суффикса -ун, который в немецкой ономастике часто несет усилительное или ласкательное значение. То есть Гердун — это «большой Герд» или попросту «Герд, сын Герда».

В русском контексте фамилия Гердун — явный пришелец. Она не вписывается в типичную славянскую модель с суффиксами -ов, -ев или -ин. Скорее всего, предки носителя этой фамилии были выходцами из немецкоязычных земель (Пруссия, Саксония, прибалтийские губернии) и переселились в Россию в XVIII–XIX веках — в эпоху приглашения колонистов Екатериной II или позже. Фамилия могла закрепиться в обрусевшей среде, но сохранить исходное звучание.

Поскольку фамилия редкая, её география узкая. Встречается она преимущественно на западе России и в бывших прибалтийских губерниях, а также среди потомков немецких колонистов Поволжья. Сословная принадлежность предков могла быть разной: от крестьян-ремесленников до городских мастеровых или военных. Точных данных о массовом распространении или известных дворянских родах с такой фамилией нет — это подчёркивает её локальный и, вероятно, незнатный характер.