Фамилия Гершун — яркий пример того, как библейское имя, пройдя через языки диаспоры и русскую почву, превратилось в узнаваемую фамилию. В её основе лежит древнееврейское имя Неффалим (один из сыновей Иакова). На идише это имя трансформировалось в форму Герш (Hersch), что напрямую связано с тем же библейским корнем.

Как же появился суффикс -ун? Фамилию образовали не напрямую от имени Герш, а от его просторечной, «домашней» формы — Гершуня. Уменьшительно-ласкательные формы на -ун, -юн (как Игнат → Игнатун, Степан → Степуня) были характерны для разговорной речи. Так имя Гершуня превратилось в фамилию Гершун, закрепив за потомками связь с предком по имени Герш.

Чередование начальных «г» и «х» — не случайность, а следствие русификации. В идише и немецком звук в начале слова произносится как твёрдое «h», что в русской записи часто передавалось как «г» (ср. Гамбург, Гейне). Поэтому форма Герш в русском языке закрепилась именно с «г», хотя в других славянских языках могла бы писаться через «х».

Иногда фамилию пытаются связать с польским словом herszt — «главарь, атаман» (от немецкого Herzog — «герцог»). Однако эта версия слаба: суффикс -ун нехарактерен для польских фамилий от нарицательных слов, а географическое распространение фамилии Гершун в основном совпадает с ареалом еврейского населения (Украина, Беларусь, юг России). Поэтому связь с библейским именем остаётся основным и наиболее правдоподобным объяснением. Потомок человека по имени Герш (Гершуня) со временем и получил фамилию Гершун.