Фамилия Гершунова — женская форма, а мужская, Гершунов, образована от личного имени Гершун. В основе лежит еврейское мужское имя Гершон (или Герша), которое восходит к древнееврейскому «гершом» — «изгнанник», «пришелец». В Библии Гершон — старший сын Левия, родоначальник одного из левитских родов. Русский суффикс -ун- в данном случае не характерен для исконных славянских прозвищ: он типичен для адаптации заимствованных имён. То есть имя Гершон сначала превратилось в просторечную форму Гершун (с уменьшительным или обиходным оттенком), а затем получило стандартный русский патронимический суффикс -ов.

Фамилия Гершунов — довольно редкая. Её география связана с регионами, где исторически селились еврейские общины, прежде всего черта оседлости: Беларусь, Украина, юго-западные губернии Российской империи. После революции и в советское время носители фамилии расселились шире, но концентрация остаётся в крупных городах центральной России и бывших республиках СССР.

Словообразовательная модель здесь проста, но показательна: суффикс -ун- в еврейских фамилиях встречается нечасто. Сравните с более массовыми вариантами вроде Гершман или Гершензон — здесь же мы видим русификацию через народную форму имени. Это говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, жил в среде, где имя Гершон было в ходу в бытовом, «опрощенном» виде, а фамилию дали уже по русскому образцу, закрепив за потомками.

Если допускать вторую, менее вероятную версию, то можно вспомнить, что в русских говорах слово «герша» или «герш» не фиксируется. Но существует редкое диалектное «герш» — вид рыбы (ёрш) или прозвище ершистого человека. Однако эта версия слабая: во-первых, фамилии от названий рыб обычно образуются через суффикс -ин (Ёршин), а не -ов; во-вторых, имя Гершон даёт гораздо более прямую и исторически подтверждённую связь. Так что основное происхождение — от библейского имени через обиходную форму.

В сословном плане носители фамилии Гершунов могли быть как мещанами, так и купцами или ремесленниками — фамилия не указывает на дворянство или крестьянство, а отражает этническое и религиозное происхождение.