Фамилия Герщун — редкий случай в русском ономастиконе. Её происхождение не связано с русскими корнями, а уходит в еврейскую традицию, причём с заметным влиянием немецкого или идишского произношения. Основа фамилии — личное мужское имя Герш (или Герша), которое является сокращённой формой от Гершон (Гершом). В Библии Гершон — старший сын Левия, родоначальник одного из левитских родов. Имя это означает «изгнанник» или «чужеземец», что в контексте еврейской диаспоры было символично.

Суффикс -ун в фамилии Герщун — не типичный русский патронимический суффикс, а скорее адаптация к восточнославянской или польской фонетике. В еврейских фамилиях, особенно тех, что оформлялись на территории Российской империи, часто встречаются окончания -ун, -ан, -ин, которые добавлялись к основе, чтобы придать фамилии славянское звучание. Поэтому Герщун можно понимать как «сын Герша» или «потомок Герша», но не по модели «Герш-ов», а по более редкой модели, закрепившейся в определённых регионах.

Географически фамилия могла возникнуть в черте оседлости — на территории современных Украины, Беларуси или Польши, где еврейские общины активно взаимодействовали с местным населением. Встречаются варианты написания: Гершун, Гершунь, Гиршун. Фонетический переход «ш» в «щ» (Герш → Герщ) — характерная черта для говоров, где «щ» произносится как долгое мягкое «ш», что могло отразиться на письменной фиксации фамилии в документах XIX века.

Интересно, что фамилия Герщун не имеет отношения к немецкому слову «Hirsch» (олень), хотя внешне похожа. В немецкой среде существовала фамилия Гирш, но с суффиксом -ун она почти не встречается. Таким образом, наиболее правдоподобная версия — еврейское происхождение от библейского имени Гершон, адаптированное через славянскую словообразовательную модель. Носители фамилии, скорее всего, были выходцами из мещанских или купеческих семей местечек, а их предки могли быть связаны с религиозной общиной — левитами, имевшими особые обязанности в синагоге.