Фамилия Гильианова — редкая и нестандартная для русского ономастикона. Её основа, судя по всему, не славянская, а скорее всего, восходит к тюркскому или арабскому имени Гильян (варианты — Гильман, Гильми). В татарском и башкирском языках есть имя Гильян (от арабского «гильм» — знание, наука), а также фамилии Гильманов, Гильмиев. Если это так, то фамилию образовали по русской модели: к основе Гильян добавили суффикс -ов, а затем — типичное окончание -а для женского рода. Но в данном варианте — «Гильианова» — обращает на себя внимание удвоенная буква «и»: Гильиан, а не Гильян. Это может быть следствием диалектного произношения (растянутый гласный) или ошибки писаря при записи фамилии в документах. В любом случае, основа — личное имя или прозвище.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: связь с греческим именем Илиан или Илья (через Илиан → Гильиан). Однако приставка «Г-» в начале для русских фамилий нехарактерна, если только это не искажение отчества (например, «Гильианов» могло возникнуть из «Гильиан» как вариант «Ильиан» с протезой «г»). Но такое редкость, и первая гипотеза выглядит убедительнее.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: носитель фамилии — потомок человека по имени или прозвищу Гильиан (Гильян). В крестьянской среде такие фамилии часто закреплялись за целыми семьями, и если предок был выходцем из татарских или башкирских земель (например, из Поволжья или Приуралья), то фамилия могла сохраниться в русском окружении. Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в записях XIX–XX веков на территории бывшей Казанской или Оренбургской губерний. Сословно — скорее всего, крестьянская или мещанская, без дворянского корня.

Что касается написания с двумя «и»: современные носители могут столкнуться с путаницей в документах — одни пишут «Гильянов», другие «Гильианов». Точное происхождение конкретной ветви можно выяснить только по архивным метрическим книгам или ревизским сказкам. Но в целом фамилия Гильианова — это редкий пример того, как восточное имя обросло русским суффиксом и закрепилось в форме, которая сегодня кажется необычной даже на фоне соседних Гильмановых и Гильмиевых.