Фамилию Глуховецкий чаще всего связывают с названием населённого пункта — села, местечка или хутора с корнем «Глухов-». Таких топонимов на восточнославянских землях немало: Глухов (город в Сумской области Украины, известный с XII века), Глуховцы (село в Житомирской области), Глухово (десятки деревень в России и Белоруссии). Формант -ецкий указывает на географическое происхождение (как в фамилиях Ржевский, Могилевский) и буквально означает «выходец из Глухова» или «тот, кто владел землями в Глуховцах». В польской ономастической традиции суффикс -ецкий (-ecki) был типичен для шляхетских фамилий, образованных от названий имений, поэтому не исключено, что первые носители Глуховецких принадлежали к мелкопоместной шляхте Речи Посполитой.

Основа «глух-» в топониме восходит к древнерусскому прилагательному «глухой» — в значении «глухой лес», «глухое место», то есть удалённое, заросшее, малолюдное. Поэтому фамилия не связана с глухотой как физическим недостатком, а скорее с ландшафтной характеристикой поселения. В метрических книгах XIX века фамилия встречается преимущественно на территории Волынской, Киевской и Подольской губерний — там, где были сёла с похожими названиями.

В русском языке фамилия удерживает ударение на втором слоге — Глухо́вецкий, хотя в украинском варианте возможно смещение. Примечательно, что в дореволюционных документах встречаются варианты написания: Глуховецкій, Глуховецкой — последнее отражает старую форму прилагательного (ср. «дворянин Глуховецкой»). В советское время написание унифицировалось, но сама фамилия осталась редкой: по данным современных телефонных справочников, наибольшая концентрация Глуховецких — в Хмельницкой и Винницкой областях Украины, а также в южных регионах России, куда переселялись крестьяне в ходе столыпинской аграрной реформы.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает точнее определить её происхождение. Глухов, Глуховский, Глуховцев — все они отталкиваются от того же топонима, но разными суффиксальными моделями. Глуховецкий стоит в одном ряду с Глуховец, Глуховченко, указывая на более конкретную привязку к небольшому поселению. Если предок носителя был записан как «Глуховецкий» в исповедных ведомостях XVIII века, это почти наверняка означало, что он либо родился в Глуховцах, либо владел там наделом.