Фамилия Глушень звучит необычно для русского уха — и дело не только в редкости, но и в суффиксе. В русских фамилиях продуктивны суффиксы -ов, -ин, -ский, а вот -ень встречается реже. Чаще всего он закрепляется за прозвищами, которые оформились в фамилию без дополнительного патронимического суффикса, то есть в «чистом» виде. Такую модель называют «усечённой» или «прозвищной» фамилией: прозвище Глушень стало фамилией напрямую, минуя привычное притяжательное окончание.

Корень у фамилии прозрачный — «глуш». По одной из версий, он восходит к слову «глушь»: отдалённое, густо заросшее место, чаща или малолюдная местность вдали от городов. В этом случае прозвище Глушень могли дать человеку, который жил в глухом лесу, на отшибе, или же тому, кто сам был нелюдимым, замкнутым.

Но есть и другая, более конкретная версия. В псковских говорах «глушень» означает глухаря. Такое прозвище мог получить охотник, добывавший глухарей, или человек, чем-то напоминавший эту птицу — например, глуховатый или тугой на ухо. В народе глухаря нередко связывали с особенностями слуха, и прозвище могло указывать на физическую особенность.

Наконец, нельзя исключать связь с глаголом «глушить». Если прозвище пошло от него, то Глушень — это либо рыбак, который бил рыбу острогой или «глушил» её особым способом, либо человек с тяжёлым, властным нравом, способный «глушить» окружающих своей силой или вспыльчивостью. Из трёх версий диалектная (глухарь) выглядит наиболее правдоподобной: она объясняет и редкий суффикс, и прямую связь с конкретным словом, зафиксированным в говорах.