Фамилия Гнатюк — яркий пример того, как в украинской и белорусской традиции перерабатывали полные церковные имена. В её основе лежит крестильное имя Игнатий (от латинского ignotus — «неведомый» или, по другой версии, ignis — «огонь»). Святым покровителем этого имени считается патриарх Игнатий Константинопольский, живший в IX веке.

Главное, что отличает фамилию Гнатюк от множества других «игнатьевских» фамилий, — суффикс -юк. В восточнославянской ономастике он выполняет сразу две функции: указывает на происхождение («сын Игната») и жёстко привязывает фамилию к юго-западным землям. Если Игнатьев — это фамилия, типичная для центральной России, то Гнатюк — маркер того, что предки жили на территории современной Украины, в Беларуси или на юго-западе России, в зоне влияния украинского языка.

В разговорной речи имя Игнатий сократили до формы Гнат (отпало начальное «и» — явление, характерное для украинского и польского языков). От этой краткой формы и пошла фамилия: Гнат + юк. Аналогичным образом образованы Степанюк, Романюк, Павлюк.

Интересно, что носители фамилии Гнатюк не обязательно были потомками человека по имени Гнат. В некоторых случаях так могли назвать внебрачного ребёнка или приёмного сына, которому давали фамилию по имени главы семьи. Однако в подавляющем большинстве случаев это просто отчество, закрепившееся в третьем поколении.

Социальный состав носителей фамилии Гнатюк в XIX веке был преимущественно крестьянским и казачьим. В ревизских сказках и метрических книгах Подольской, Волынской и Киевской губерний фамилия встречается часто, но почти никогда — в дворянских родословных книгах, если это не случай перехода в шляхетство через выслугу.

В написании фамилии возможны варианты: Гнатюк, Гнатюк (через «и»), реже — Гнатук. Последний вариант — результат региональных фонетических особенностей, когда «ю» редуцируется до «у» в безударной позиции. В польской традиции фамилия могла записываться как Hnatiuk или Gnatiuk.