Фамилия Гнидюк — редкий случай, когда основой послужило слово с отрицательным, почти бранным значением, но механизм образования фамилии типичен для украинской ономастики. В её основе лежит прозвище Гнида, которое в народной речи означало не только насекомое (гниду — яйцо вши), но и переносно — мелочного, придирчивого, докучливого человека. Прозвище было нелестным, но в среде, где фамилии закреплялись за крестьянами и казаками в XVII–XVIII веках, такие «обидные» имена давали не столько для оскорбления, сколько как оберег или просто по внешней или поведенческой примете.

Суффикс -юк указывает на западноукраинское происхождение. Он характерен для фамилий Волыни, Подолья, Галиции и Полесья. В словообразовательной модели Гнид-юк суффикс выполняет две функции: указывает на принадлежность (сын Гниды) или на уменьшительность (маленький Гнида). То есть Гнидюк — это буквально «потомок того, кого звали Гнида», или «Гнида-младший». Аналогичные модели — Ковалюк (сын кузнеца), Степанюк (сын Степана).

В отличие от восточнославянских фамилий на -ов (Гнидов), которые фиксируют отчество отца, форма на -юк сохраняет прямую связь с личным прозвищем и характерна для регионов, где долго не было крепостного права и фамилии оформлялись позднее, часто по имени или прозвищу главы семьи. По сословной принадлежности Гнидюки, скорее всего, были свободными крестьянами, мещанами или казаками, а не дворянами.

Встречается фамилия преимущественно в западных областях Украины — в Тернопольской, Хмельницкой, Ровенской, а также среди украинской диаспоры. В России она редка и почти всегда указывает на украинские корни предков. Несмотря на неблагозвучную основу, фамилия Гнидюк — обычный пример того, как нейтральный ономастический механизм (прозвище + патронимический суффикс) закрепляет за потомками бытовое слово, которое со временем теряет первоначальную окраску и становится просто родовым именем.