Фамилия Годаков — одна из тех, где на первый взгляд всё ясно, а при ближайшем рассмотрении начинаются вопросы. Суффикс -ов указывает на стандартную модель русской фамилии: от имени или прозвища предка через притяжательное прилагательное («чей?» — Годаков, то есть сын Годака). Основа же — Годак — неочевидна.

Самая вероятная версия: Годак — это форма древнерусского нецерковного имени Год, Годяй или Годко. В старину такие имена давали по желаемым качествам: «годный» означало «подходящий, способный, угодный». В говорах «годяй» — расторопный, ловкий человек. Фамилия могла закрепиться за сыном такого Годяя или Годака. Подобные имена встречаются в актах XV–XVII веков, например, крестьянин Годко упоминается в новгородских писцовых книгах.

Вторая версия связывает фамилию с прозвищем от глагола «годить» — ждать, выжидать, медлить. Годаком в некоторых областях называли медлительного или нерешительного человека. Эта гипотеза слабее: прозвища от «годить» обычно образовывались с другими суффиксами (Годила, Годун), а форма на -ак скорее характерна для южнорусских и украинских говоров, где «годак» могло означать «ровесник» (от «год» в значении «возраст»).

Стоит обратить внимание на географию. Фамилия редкая, но встречается в старых переписях Курской, Орловской и Воронежской губерний. Это как раз зона, где активно работал суффикс -ак (сравните: Бойко — Бойков, Гуляко — Гуляков). Поэтому наиболее правдоподобно, что Годаков — потомок человека, которого в южнорусских землях называли Годаком, то есть «годным», умелым или просто ровесником, сверстником. Других версий, заслуживающих серьёзного внимания, ономастика не предлагает.