Фамилия Годненко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, означающий «сын» или «потомок», был особенно популярен на Левобережной и Слободской Украине в XVII–XVIII веках. Годненко буквально значит «сын Годного» или «потомок Годни», где Годня — это прозвище или производное от имени.

Корень «Годн-» восходит к древнерусскому прилагательному «годный» — в значении «подходящий, способный, пригодный». В диалектах слово могло иметь оттенок «угодный, приятный». Прозвище Годный давали человеку дельному, умелому, на которого можно положиться. Реже — тому, кто всем угождал. Встречается и версия, что основа связана с глаголом «годить» (ждать, выжидать), но она менее убедительна: прозвище «Годня» скорее характеризовало качество, а не действие.

Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит каноническое имя Годон или Годен — редкая форма от греческого «Евгений» (благородный). Однако в украинской среде такие варианты почти не фиксируются, и бытовая прозвищная версия остается основной.

Фамилия Годненко распространена в центральных и восточных областях Украины, особенно в Полтавской, Черкасской и Сумской областях. В России встречается реже, в основном среди потомков переселенцев с Украины. Белорусский аналог — фамилия Годнев, где суффикс -ев указывает на принадлежность.

В дореволюционных метрических книгах фамилия записывалась через «о» (Годненко), хотя в разговорной речи возможна путаница с «Гадненко» (от «гад» — пресмыкающееся). Это разные фамилии, и путать их не стоит: Годненко всегда имеет положительный оттенок «годный, способный».