Фамилия Годнюк — яркий пример украинской модели фамильного суффикса -ук/-юк, который в восточнославянской ономастике означает «маленький» или «потомок». В данном случае суффикс -юк присоединён к основе Годн-, что прямо указывает на прозвище предка: Годний или Годный. В диалектах украинского и южнорусского наречий слово «годний» означало «пригодный», «способный», «здоровый», «крепкий», а также «умелый». Человек, получивший такое прозвище, мог быть физически сильным, работящим или мастером на все руки — тем, на кого можно положиться в деле.

Менее вероятная, но встречающаяся в народной этимологии версия связывает фамилию с глаголом «годити» — угождать, приноравливаться. Однако в этом случае прозвище носило бы скорее ироничный оттенок («угодник»), и для него логичнее была бы форма Годник, а не Годнюк. Кроме того, в говорах Полесья и Волыни «годнюк» могло быть прозвищем для младшего или самого младшего в роду — буквально «малый Годный», по аналогии с парными формами вроде «Иван» и «Иванюк».

Фамилия Годнюк распространена преимущественно на западе Украины — в Волынской, Ровенской, Львовской областях, а также в приграничных районах Беларуси и Польши, где исторически жили украинцы. В России фамилия редкая и встречается в основном у потомков переселенцев с Украины конца XIX — начала XX века. По сословной принадлежности предки Годнюков были, скорее всего, крестьянами или мещанами — фамилия сформировалась в простонародной среде, где прозвища часто давали по личным качествам, а не по профессии.

Особенность этой фамилии — её прозрачная внутренняя форма: почти любой носитель фамилии Годнюк интуитивно чувствует, что в основе лежит слово «годный», и это не требует специальных ономастических изысканий. В отличие от многих фамилий, где корень затемнён, здесь связь с живым языком сохранилась.