Фамилия Гоголицына — женская форма фамилии Гоголицын, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Гоголица. В основе лежит слово «гоголь» — так на Руси называли птицу из семейства утиных, нырка. В переносном смысле «гоголем» называли щеголя, франта, человека, который держится важно, выступает с гордым видом (отсюда выражение «ходить гоголем»). Суффикс -иц- в прозвище Гоголица мог указывать на жену или дочь человека по прозвищу Гоголь, либо быть уменьшительно-ласкательной формой. То есть Гоголица — это либо «жена Гоголя», либо «маленький Гоголь» (в значении «сын» или «подросток»). Фамилия образована по стандартной для русского севера модели: основа на -а плюс суффикс -ин (чей? — Гоголицын). Такая модель типична для новгородских и вятских земель, где фамилии часто фиксировали принадлежность к главе семьи.

Встречается фамилия в основном в центральных и северных областях России, особенно в бывших новгородских пятинах и на Вятке. В писцовых книгах XV–XVII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с прозвищем Гоголь или Гоголица. Связь с украинским писателем Николаем Гоголем здесь только внешняя: его фамилия образована от той же основы, но по польско-украинской модели (Гоголь → Гоголь-ский), тогда как Гоголицын — чисто русский, северный вариант с суффиксом принадлежности.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: от названия растения «гоголь» — так в некоторых говорах именовали кубышку жёлтую или другие водные травы. Но в ономастике связь с птицей и поведением человека считается основной, поскольку прозвища по внешним чертам и повадкам были распространены гораздо шире, чем по названиям растений. Таким образом, предок современных Гоголицыных, скорее всего, был либо заметным, «видным» человеком, любившим приодеться, либо, наоборот, получил прозвище с иронией — за неуклюжую попытку казаться важным.