Фамилия Голонкова — женская форма фамилии Голонков, и её стоит разбирать через мужской вариант, который образован по стандартной русской модели с суффиксом -ов. Основа здесь — прозвище или неканоническое имя Голонок. Что стоит за этим словом — вопрос, требующий внимания, потому что корень «гол-» в русских фамилиях многозначен.

Самый прямой путь — связать Голонка с прилагательным «голый». В говорах «голонок» могли называть человека бедного, раздетого или, наоборот, лысого (от «голый» в значении «без волос»). Однако есть нюанс: суффикс -онок в прозвищах часто указывал на молодость или уменьшительность, как в фамилиях Ребёнок, Козлёнок. Тогда Голонок — это «голыш», «маленький голый ребёнок» или, в переносном смысле, бедняк, не имеющий ничего за душой. Версия с лысиной менее вероятна: для лысого человека использовали бы форму Голыш или Головатый, а не Голонок.

Другой вариант — происхождение от слова «голень» (часть ноги). Прозвище Голонок мог получить человек с заметными, длинными или тонкими голенями. Такие прозвища по частям тела — обычное дело в русской ономастике (сравните: Нос, Лоб, Щека). Но здесь есть фонетическая трудность: в слове «голень» корень «голен-», а в фамилии — «голон-». Это могло возникнуть из-за аканья (в южнорусских говорах «голень» произносили как «галень», а «голонок» — как «галонок») или из-за переосмысления: народная этимология могла сблизить малопонятное «голенок» с более ясным «голый».

Географически фамилия Голонков встречается нечасто, но имеет отчётливую привязку к югу России и Украине. В документах XIX века носители фамилии фиксировались в Курской, Воронежской губерниях и в области Войска Донского. Это регионы, где активно действовали уменьшительные суффиксы -онок/-ёнок, характерные для украинского влияния. В украинском языке «голонок» могло быть прямым производным от «голий» (голый) с тем же значением «голыш».

Таким образом, предок современных Голонковых, скорее всего, получил прозвище за бедность или за внешнюю особенность — возможно, за то, что ходил в обносках, или за детскую худобу. Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или казачья, что подтверждается ареалом распространения.