Фамилия Голонцова — женская форма, мужской вариант — Голонцов. В её основе лежит прозвище или мирское имя, которое в русской традиции могли дать человеку с заметной внешней чертой. Слово «голонец» или «голонцы» в северных и сибирских говорах означало «голый», «лысый», «оголённый». Чаще всего так называли человека с рано облысевшей головой, либо того, кто ходил без шапки в холод, — черта, бросавшаяся в глаза и легко закреплявшаяся за человеком в быту.

Суффикс -ов- указывает на типичную для русских фамилий модель принадлежности: Голонцов — сын Голонца. Такие фамилии в XV–XVII веках складывались у крестьян, посадских людей и служилых, когда отчество на -ов постепенно переходило в наследственное прозвание. Фамилия недворянская, не книжная, а «уличная» — из живой речи, что подтверждает её простонародное происхождение.

Интересная деталь: в некоторых говорах «голонцы» называли также бедняков, у которых «голо» в хозяйстве и одежде. Возможно, прозвище относилось не только к внешности, но и к скудному достатку. Однако лингвистически первичнее значение «лысый» — оно встречается в памятниках русской диалектной лексики чаще.

Географически фамилия тяготеет к северу России и Уралу. В переписях XIX века носители фамилии Голонцовы фиксировались в Вологодской, Архангельской и Пермской губерниях. Это согласуется с тем, что слово «голонец» — севернорусский диалектизм. В центральных и южных областях России фамилия встречается реже, что делает её хорошим маркером возможных корней семьи.

Сравните с однокоренными фамилиями: Голышев, Голыгин, Голобородько — все они образованы от корня «гол-» со значением «голый, лишённый покрова». Голонцов стоит в этом ряду как вариант с уменьшительным суффиксом -ец, который мог придавать прозвищу оттенок иронии или ласки («голый малый»).

В целом фамилия редкая, нераспространённая, что повышает вероятность того, что все её носители — потомки выходцев из одного или нескольких близких селений на Русском Севере.