Фамилия Голыничев — из тех, что сразу настораживают: слишком похожа на «голый». И это не случайно, хотя прямой связи с наготой тут нет. В основе лежит древнерусское прозвище Голынь или Голыня. Слово «голынь» в говорах означало не только «бедность» или «голь перекатную», но и «открытое, голое место» — например, безлесую равнину или пустошь. Человек мог получить такое прозвище за скудное житьё («гол как сокол»), а мог и за то, что жил на голом, ничем не поросшем участке.

Словообразовательная модель здесь архаичная. Суффикс -ич- в русских фамилиях обычно указывает на отчество от прозвища с основой на мягкий согласный: Голыня → Голынич (сын Голыни). А конечное -ев — это уже более поздняя адаптация под стандартную патронимическую форму, типичную для северных и центральных русских земель. То есть фамилия прошла путь: Голыня → Голынич → Голыничев. Это не самая частая модель, она встречается реже, чем простые -ов или -ин, что говорит о возможном локальном бытовании.

Интересно, что фамилия Голыничев практически не встречается в южнорусских и украинских землях — её ареал тяготеет к северу: Вологодская, Архангельская, отчасти Костромская области. Там же, кстати, фиксируется и фамилия Голыгин, образованная от того же корня, но через другую суффиксацию. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные примеры разбираются в разделе прозвищ, связанных с социальным положением, но он специально оговаривает, что «голый» могло быть не только уничижительной характеристикой, а и указанием на место жительства.

Ещё одна версия, которую иногда выдвигают, — связь с диалектным «голынь» в значении «гололедица» или «скользкое место». Тогда прозвище могло достаться человеку неловкому, постоянно падающему. Но эта гипотеза слабее: слишком узкое значение, которое не подтверждается массовым употреблением слова в документах XVI–XVII веков.

Так что, скорее всего, предок носителя фамилии Голыничев был либо человеком небогатым, либо жил на пустоши — и это закрепилось за его потомками в виде редкой, но выразительной фамилии.