Фамилия Гонсецкий звучит на польский лад, и это не случайно. Её основа — польское слово gąsior, которое имеет два значения: «гусак» (самец гуся) и «кувшин с узким горлышком» (такой формы, напоминающей гусиную шею). Суффикс -ский (-ski) — типичный для польской шляхетской фамильной модели, указывающий на происхождение от названия поместья или прозвища. В русской передаче носовое польское «ą» превратилось в «он», отсюда Гонсецкий, а не Гонсенцкий или Гансецкий.

Наиболее вероятное объяснение — фамилия образована от прозвища Гонсёр (Gąsior), которое давали человеку с длинной шеей, выпуклой грудью или, по другой версии, за привычку выпивать из кувшина. В польской ономастике фамилии на -ski с такой основой нередко фиксировались среди мелкой шляхты, владевшей хуторами или усадьбами, названными по прозвищу владельца. Например, Гонсецкий мог означать «тот, кто из усадьбы Гонсёра» или просто «сын Гонсёра».

Встречаются и два более редких варианта происхождения. Первый — топонимический: в Польше есть несколько деревень с названием Гонсёры (Gąsiory), и выходец оттуда получал фамилию Гонсецкий. Второй — профессиональный: гонсёром могли называть птицевода, разводящего гусей. Однако для фамилии на -ский версия с прозвищем и шляхетским суффиксом выглядит убедительнее: в Речи Посполитой именно так закрепляли родовое имя.

В России фамилия встречается редко, преимущественно в западных областях, граничащих с Польшей и Беларусью, а также среди потомков польской шляхты, перешедшей на русскую службу. В дореволюционных документах Гонсецкие фиксировались и как дворяне, и как мещане — сословная принадлежность зависела от того, успела ли семья подтвердить шляхетство после разделов Польши. В написании иногда путают с более известной фамилией Гончаровский, но корень у них разный: там гончар, а здесь гусь.