Фамилия Гонюк — яркий пример украинской модели фамилий, образованных от личного прозвища. Её основа — «гоня» или «гонюк» — в украинских говорах могла означать человека, который гоняет, погоняет, например, скотину или лошадей. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, украинские на -юк (как и на -ук, -чук) указывают на принадлежность: буквально «маленький» или «сын того, кого звали Гонь». То есть Гонюк — это потомок человека по прозвищу Гоня.

Словообразовательный суффикс -юк — один из самых распространённых на западе и в центре Украины, особенно на Волыни, Подолье и в Галиции. Фамилия Гонюк с таким суффиксом почти наверняка имеет западноукраинские корни. Интересно, что однокоренные фамилии — Гонь, Гонько, Гончаренко — образованы от той же основы, но с другими суффиксами и в других регионах. Сравнение с ними показывает, что Гонюк стоит в ряду «младших» фамилий, которые закрепились позже, когда суффикс -юк уже активно вытеснял более старые -енко.

Версия о связи с глаголом «гнать» не единственная. В некоторых диалектах «гоня» могло быть прозвищем быстрого, нетерпеливого человека, того, кто постоянно торопит. Есть и более редкое предположение, что основа восходит к слову «гон» в значении «участок земли» (гон земли) — тогда прозвище мог получить земледелец. Однако первая версия — от погонщика или торопыги — выглядит убедительнее: она проще и типична для прозвищной традиции.

В дореволюционных источниках фамилия встречается в основном среди крестьян и казаков. Дворянских родов Гонюк не зафиксировано — это однозначно фамилия простого сословия, что подтверждается её прозрачной «ремесленной» или поведенческой основой. Сейчас Гонюки живут не только на Украине, но и в России, Беларуси, а также в диаспорах Северной Америки, куда фамилия попала с волнами эмиграции конца XIX — начала XX века.