Фамилия Гопанюк почти наверняка украинская и образована по той же модели, что и тысячи других фамилий на -юк. Суффикс -юк (в восточнославянских языках часто чередуется с -ук) — типичный патронимический показатель в западных и центральных регионах Украины. Он означает «сын» или «потомок», как, например, в фамилиях Шевчук, Ковальчук, Тарасюк. Следовательно, Гопанюк — это «сын Гопана» или «потомок Гопана».

Корень «Гопан-» неочевиден и допускает несколько трактовок. Самая прямая версия: в основе лежит прозвище Гопан, которое, в свою очередь, могло произойти от украинского глагола «гопати» — в диалектах это может означать «топать», «стучать», «громко ходить», а также «кричать «гоп!»». В таком случае прозвище могли дать шумному, энергичному человеку, любителю громких команд или просто тому, кто ходил тяжело, вразвалку. Вторая версия, менее вероятная, но возможная: связь с диалектным словом «гопан» — так на западе Украины могли называть бродягу или несерьёзного человека (сравните с польским «hop» — прыжок, скачок). Третья, самая редкая гипотеза — что это усечённая форма от церковного имени Агапий (греч. «любовь»), где «Гопан» могло возникнуть как бытовое сокращение.

Географически фамилия Гопанюк наиболее плотно бытует на западе Украины, преимущественно в Тернопольской, Ивано-Франковской и Львовской областях. Это подтверждает её западноукраинское происхождение и типичную модель образования. В России фамилия встречается редко и, скорее всего, связана с миграцией украинского населения.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Есть фамилии Гопанчук (с другим суффиксом -чук), Гопаненко (с суффиксом -енко, характерным для центральной и восточной Украины), а также просто Гопан. Все они восходят к одному корню, и их ареал подтверждает, что основа — не заимствование, а местное прозвище. Сословной принадлежности предков по фамилии Гопанюк установить нельзя: патронимические фамилии на -юк в Украине носили и крестьяне, и казаки, и мещане.