Фамилия Городниченко образована по украинской модели с суффиксом -енко, который в XVI–XVII веках означал «сын» или «потомок» и закрепился на восточных землях Речи Посполитой, а позже — в Малороссии и Новороссии. Это указывает, что носители фамилии происходят с территорий современной Украины или южных областей России, где такие фамилии массово фиксировались в реестрах казаков и мещан. Основа фамилии — Городниченко — образована от прозвища Городник.

Прозвище Городник восходит к нарицательному «город» — в древнерусском языке это слово означало не только крупное поселение, но и «огороженное место», «крепость» или даже «огород». Отсюда два основных толкования. Первое: Городником могли называть человека, который переселился из города в деревню — пришлый, «городской» среди сельских жителей, что легко становилось устойчивым прозвищем. Второе, менее очевидное: в некоторых говорах «городник» означало болтуна, пустослова — человека, который «городит» вздор. Эта версия поддерживается тем, что глагол «городить» в переносном смысле (нести чепуху) известен в русских диалектах с XVII века.

Менее вероятно, но не исключено, что прозвище могло быть связано с ремеслом: например, строителем оград или укреплений (городьбы). Однако в исторических документах такая профессия не зафиксирована как распространённое прозвище, поэтому версия с переселенцем или говоруньей остаётся основной.

Суффикс -енко в фамилии Городниченко нестандартен: обычно прозвища на -ник дают фамилии на -ников (Городников), но здесь основа усложнена вставкой -ич- перед патронимическим суффиксом. Такая форма встречается реже и характерна для западных регионов Украины (Волынь, Подолье), где патронимы на -енко нередко присоединяли к уже существовавшим прозвищам на -ник, создавая двойную суффиксацию. Таким образом, фамилия буквально означает «сын Городника».

В итоге: носители фамилии Городниченко — потомки человека, которого в украинской или южнорусской среде прозвали Городником, скорее всего, за городское происхождение или за привычку говорить лишнее. Фамилия закрепилась в XVIII–XIX веках, когда патронимы на -енко стали наследственными, и сегодня встречается преимущественно в Черкасской, Полтавской и Днепропетровской областях, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Сибири.