Фамилия Городничина — женская форма от Городничин, а та, в свою очередь, от прозвища Городничий. Вопреки первому впечатлению, прямой связи с должностью городничего (полицейского начальника уездного города в Российской империи) здесь нет, иначе фамилия звучала бы как Городничев. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Городничин — «сын Городничего». А само прозвище Городничий в XVI–XVII веках означало не чиновника, а человека, который либо жил в городе (в отличие от сельского жителя), либо происходил из посадского населения, либо имел отношение к городскому управлению на низовом уровне — например, был городским старостой или сотским. В словаре Б. Унбегауна отмечено, что фамилии на -ий, переходящие в -ин, фиксируют именно прозвищную, а не должностную основу.

Регионально фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России, где было распространено слово «городничий» в значении «житель города» или «горожанин». В некоторых говорах «городничим» называли также сторожа при городских воротах или смотрителя за порядком на торгу — то есть человека, который «городил» (огораживал, охранял). Это добавляет ещё один возможный корень: от глагола «городить» — огораживать, ставить изгородь. Так что предок носителя фамилии мог быть не просто горожанином, а тем, кто отвечал за городские укрепления или заборы.

Ударение в фамилии падает на второй слог: Городни́чина. Вариант с ударением на «и» (Городи́чина) встречается реже и может указывать на искажение в документах или смешение с фамилией Городин. В написании через «о» после «г» (Городничина) сохраняется этимологическая связь с городом, тогда как вариант «Гарадничина» — чисто фонетический, свойственный южнорусским говорам.

В целом фамилия редкая, недворянская, крестьянско-мещанского происхождения. Её носители — потомки тех, кого в переписных книгах XVII века записывали как «городничий человек», то есть не служилый, а посадский, живший в городе своим хозяйством или ремеслом.