Основой фамилии Горюнков послужило мирское имя Горюнок. Мирское имя Горюнок ведет свое начало от нарицательного «горюн» со значением «горемыка, тот, который бедствует». В данном случае, надеясь иметь счастливого и здорового мальчика, родители назвали его Горюнком. Кроме того, горюнами в старину называли жителей Путивльского уезда Курской губернии. Поэтому не исключено, что данная фамилия образована от прозвища Горюнок, которое указывает на место жительства предка. Одно из первых упоминаний имени родственных именований в письменных источниках относится к началу XVI века: в «Ономастиконе» С.Б. Веселовского записан княжеский межевщик Горюн Шемякин их Московского уезда, 1524 г.