Фамилия Горюнкова — женская форма фамилии Горюнков. Её основа — прозвище или нецерковное имя Горюн. В русской ономастике слово «горюн» имеет два основных значения, и оба могли дать начало фамилии.

Первое и самое прямое — «тот, кто горюет», «горемыка», «бедолага». В говорах горюном называли человека, которому постоянно не везло, или того, кто жаловался на судьбу. Такие прозвища были распространены в крестьянской среде: имя давали не в насмешку, а как оберег, чтобы злая доля обошла стороной. По этой версии, предок Горюнковых получил прозвище за печальный нрав или тяжёлую жизнь.

Второе значение — диалектное. В архангельских и вологодских говорах «горюн» — это вид кулика, болотной птицы. Прозвище могли дать человеку за длинноногость, сутулость или привычку ходить, опустив голову, как птица во время кормёжки. Эта версия менее известна, но она объясняет, почему фамилия встречается в северных регионах России.

Суффикс -ов- в основе Горюнков указывает на типичную русскую модель образования: сначала от прозвища Горюн образовалось отчество Горюнов (чей сын? — Горюнов), а затем от него — фамилия Горюнков. Форма на -ков встречается реже, чем на -ов, и часто указывает на более позднее закрепление фамилии или на региональные особенности словообразования. В некоторых говорах суффикс -к- добавляли к уже готовой фамилии для различения ветвей рода: Горюновы и Горюнковы могли жить в одной деревне, но принадлежать к разным семьям.

География фамилии подтверждает её северное происхождение. Основные очаги — Архангельская, Вологодская и Кировская области. В переписях XVII–XVIII веков Горюнковы встречаются среди черносошных (государственных) крестьян, которые не были крепостными и платили налог напрямую казне. Сословная принадлежность типична для большинства носителей: фамилия не дворянская, а крестьянская или посадская.

В написании возможна путаница с фамилией Горюнова, но разница в суффиксе принципиальна. Горюнова — от имени Горюн (без промежуточного -к-), а Горюнкова — от отчества Горюнков, то есть «внук Горюна». Если вы встретили оба варианта в одной семье, скорее всего, это результат канцелярской ошибки при записи в метрических книгах.