Фамилия Господаров образована не от имени, а от прозвища или социального статуса. В её основе — старинное слово «господарь», которое в древнерусском языке означало «господин, хозяин, повелитель, владелец». Это слово было широко распространено не только в России, но и в соседних славянских землях: в Молдавии и Валахии «господарем» называли правителя, князя. Однако в русской крестьянской среде прозвище Господарь могло иметь иной оттенок.

Вероятнее всего, фамилию Господаров получил не сам господин, а его слуга или крепостной крестьянин, живший в имении человека по прозвищу Господарь. Такая модель — когда фамилия образовывалась от имени или прозвища хозяина — типична для русских «барских» фамилий (сравните: Бояринов, Князев). Прозвище Господарь могло закрепиться и за гордым, властным человеком, который вёл себя по-хозяйски, независимо от своего реального социального положения.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»). Первоначально Господаров — это «сын Господаря» или «человек из семьи Господаря». Со временем прозвище перешло в фамилию, закрепившись за родом.

Фамилия редкая и не относится к числу распространённых дворянских. Встречается в основном на юге России и в областях, граничивших с Молдавией, что может указывать на региональную привязку слова «господарь» в его правительственном значении. Сравните с однокоренными фамилиями Господинов, Господчиков — они образованы от той же основы, но с разными суффиксами, что меняет оттенок значения.