Фамилия Гришунин образована от производной формы крестильного имени Григорий. В основе лежит народная, обиходная форма Гришуня — так в быту могли называть Григория. Само имя Григорий пришло из греческого языка и означает «бодрствующий», «бдительный».

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: суффикс -ин присоединялся к основе, оканчивающейся на -а или -я. Гришуня → Гришунин буквально означает «сын Гришуни» или «потомок Гришуни». Такая модель широко распространена в северных и центральных областях России, где фамилии на -ин особенно частотны.

В отличие от фамилий на -ов (например, Гришунов), форма Гришунин указывает на конкретное прозвищное или уменьшительное имя отца. Это позволяет предположить, что предок носителя фамилии был известен в своей среде именно как Гришуня — либо по возрасту, либо по родственному или дружескому обращению.

Фамилия Гришунин не относится к числу самых распространённых, но встречается в разных регионах России, особенно в Поволжье и на Урале. Встречаются варианты написания с одной или двумя буквами «н» (Гришунин / Гришунин), что связано с колебаниями в оформлении суффикса в исторических документах.

Таким образом, фамилия Гришунин — это типичная «патронимическая» фамилия, образованная от уменьшительной формы имени Григорий. Она прямо указывает на имя предка и не содержит дополнительных профессиональных или географических подсказок.