Фамилия Грудына звучит скорее как западнорусская или украинская, чем как великорусская. Её происхождение, скорее всего, связано не с «грудой» (кучей), а с диалектным словом «груда» или «грудка» — так в некоторых говорах называли грубую, неровную поверхность, бугор, кочку, а также кусок чего-то твёрдого, глыбу. В украинском языке «груда» означает «глыба», «ком», а «грудка» — «кусок». Таким образом, прозвище Груда могли дать человеку плотного, коренастого телосложения, либо тому, кто жил на бугристой, неровной местности, либо, по другой версии, человеку, который работал с землёй, разбивал комья.

Словообразовательная модель фамилии — типично украинская или белорусская. Суффикс -ын-а (в русской передаче -ына) характерен для фамилий, образованных от прозвищ или имён с помощью притяжательного суффикса, указывающего на принадлежность: «чей?» — Грудин, Грудын. В украинской традиции окончание -а стало частью фамилии, и она склоняется как существительное женского рода, хотя носитель — мужчина. Это отличает её от русских фамилий на -ин, где ударение обычно падает на окончание в косвенных падежах.

Встречается фамилия Грудына в основном на западе России (Смоленская, Брянская области), в Беларуси и на Украине. Поскольку в этих регионах было много крестьян и мещан, фамилия, вероятно, возникла в простонародной среде, а не в дворянской. Сословной принадлежности точно определить нельзя, но по модели образования она не выглядит как фамилия, принадлежавшая знати.

Сравнение с однокоренными фамилиями: Грудин, Грудинкин, Грудкин, Грудков. Все они восходят к разным формам одного прозвища. Фамилия Грудына стоит особняком из-за своего окончания, которое может указывать на то, что её носитель был выходцем с территории, где говор на «а» (аканье) и где фамилии на -ына не редкость. Спорных версий немного: иногда её пытаются связать с польским «gruda» (куча), но это то же самое слово, только в другой орфографии. Правдоподобнее всего — связь с конкретной местной чертой человека или его занятием.