Фамилия Губецков встречается редко, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, нужно внимательно посмотреть на её основу — «Губецк-». Словообразовательная модель здесь нестандартная: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), а вот предшествующая часть — это не просто корень, а целая основа, которая сама является фамилией или прозвищем. Фактически, Губецков — это «сын Губецкого» или «человек из рода Губецких». То есть в основе лежит фамилия Губецкий, которая, в свою очередь, образована от прозвища или географического названия.

Ключ к разгадке — корень «губ-». В русских говорах слово «губа» имело не только прямое значение (часть лица), но и переносные: «губастый» — человек с толстыми губами или обидчивый, «губан» — то же самое, а также «губы» могли означать «грибы» в некоторых диалектах. Но есть и другая, более вероятная версия. В старину «губой» называли административно-территориальную единицу — судебный округ. Отсюда пошло слово «губной» (губной староста, губная изба). Человек, имевший отношение к такому округу или живший в местности, которая называлась Губец, мог получить прозвище Губецкий. Суффикс -ец в основе типичен для образования названий по месту жительства (ср. донец, кузнец, но в данном случае — от названия места).

Таким образом, наиболее правдоподобная версия: предок носителя фамилии Губецков был либо выходцем из населённого пункта с названием Губец (или Губки, Губино), либо его прозвали по должности или характерной внешности, а затем эта форма превратилась в фамилию на -ский, которая уже в следующем поколении «обрусела» до патронимической формы на -ов. Это характерно для позднего этапа формирования русских фамилий, когда фамилии на -ский, особенно польского или западнорусского происхождения, адаптировались под привычную модель на -ов. Если опираться на работы Б. Унбегауна, такая смена суффикса — не редкость для фамилий, возникших на стыке культур. Географически фамилия могла закрепиться в регионах, где было развито губное самоуправление (север и центр России), или в областях с польским влиянием (Смоленщина, западные губернии). Точных данных о конкретных известных носителях нет, но сама фамилия — яркий пример того, как местное прозвище или название должности, пройдя через два словообразовательных фильтра, превратилось в редкую и запоминающуюся родовую форму.