Фамилия Гукин — одна из тех, что образована от прозвища. В её основе лежит слово «Гука». Прозвище это, в свою очередь, связано с глаголом «гукать». В разных говорах у этого слова разные оттенки: где-то «гукать» значило издавать отрывистый, глухой звук, где-то — просто «говорить» или даже «бить, ударять». В южных диалектах была своя особенность: «гукой» называли музыканта, играющего на гуке — старинном струнном инструменте, разновидности гуслей или лиры.

Так что прозвище Гука могло закрепиться за человеком по разным причинам. Самые вероятные — либо за манеру говорить отрывисто и громко, либо за профессию музыканта. Менее распространённая версия связывает прозвище с физическим действием — ударом, но она уступает первым двум по убедительности, так как бытовые прозвища чаще отражают речь или занятие, чем разовые действия.

Словообразовательная модель здесь проста и типична для русских фамилий: к основе прозвища Гук- добавился суффикс принадлежности -ин. Так фамилия Гукин буквально означает «потомок Гуки», то есть сын или внук человека с таким прозвищем. Это патронимическая фамилия, образованная по той же схеме, что и, например, Пушкин (от Пушка) или Ильин (от Илья).

Фамилия не относится к числу распространённых дворянских, а скорее крестьянская или мещанская по происхождению, что типично для прозвищных фамилий центральной России и Поволжья. Встречается она в основном в русской среде, хотя отдельные носители могут быть и из других славянских народов.