Фамилия Гунчихина — женская форма, а мужской вариант, Гунчихин, встречается реже, что уже указывает на её происхождение: перед нами типичная «семейная» фамилия, образованная не от имени отца, а от прозвища или имени матери. Суффикс -их- (в основе Гунчих-) — характерный севернорусский и уральский маркер, который в XVI–XVII веках добавляли к основе, чтобы назвать женщину по мужу или отцу: «жена Гунчихи» или «дочь Гунчихи». Такие фамилии на -ихин/-ихина особенно часты в бывших новгородских землях, Вологодчине и на Русском Севере.

Основа «гунч-» тёмная и редкая. Вероятнее всего, она восходит к диалектному слову «гунча» или «гунчиха» — так в некоторых говорах называли ворчливую, брюзгливую женщину, либо, наоборот, тихоню, «гундеть» (говорить невнятно, монотонно). В ономастике известен корень «гун-» со значением «гудеть, гудок», но в фамилии он мог переосмыслиться через прозвище. Менее правдоподобна связь с тюркскими языками (например, «гюн» — день), так как суффикс -их- указывает на исконно русскую, а не заимствованную модель.

Первые носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми из северных уездов. Прозвище Гунчиха могла получить женщина, отличавшаяся манерой речи или характером, а её дети и внуки закрепили эту кличку как фамилию. По переписям XIX века, фамилия Гунчихины встречается в Вологодской и Архангельской губерниях, что подтверждает географию суффикса. Редкость фамилии говорит о том, что род был локальным, не разросшимся в крупное сословие. Сегодня носители фамилии живут в основном в центральной России и на Урале, но численность остаётся небольшой.