Фамилия Идиятуллин образована от мужского тюркского имени Идиятулла. В основе лежит арабское слово «идаят» (правильный путь, руководство) и «Аллах» — имя Бога. Таким образом, Идиятулла означает «идущий по правильному пути Аллаха» или «ведомый Аллахом». Это теофорное имя, то есть включающее в себя имя Всевышнего, что характерно для мусульманской традиции.

Фамилия строится по распространённой в тюркских языках модели: к личному имени добавляется русский патронимический суффикс -ин, который в данном случае указывает на принадлежность («сын Идиятуллы»). Получается типичная для татар, башкир и других народов Поволжья фамилия, где тюрко-арабская основа соединилась с русским грамматическим оформлением.

Носители фамилии Идиятуллин — потомки человека по имени Идиятулла. Скорее всего, их предки были мусульманами, жившими на территории современных Татарстана или Башкортостана. Само имя давали в надежде, что ребёнок вырастет праведным и благочестивым, следуя религиозным предписаниям. В отличие от многих русских фамилий, образованных от прозвищ или профессий, эта прямо указывает на веру и мировоззрение родоначальника.

Встречаются варианты написания: Идиятуллин, Идиятулов (с другим суффиксом) и реже — Идиятуллин. Ударение в фамилии обычно падает на последний слог, как это часто бывает у фамилий тюркского происхождения, адаптированных русским языком.